PG2でクロックが設定できない

ロートルのmlapiです。

しばらくぶりにRX210のコードを書きました。
RX210のチップバージョンCの68ピン版を使っています。
Peripheral Driver Generator V.2(PDG2)を使うとハードの初期設定等が楽に書けるので、PDG2で初期化部分を作成しましたが、思わぬ障害に出会いました。

まず最初からクロックが設定した動作になりません。
クロックの水晶が発振しません。

PDG2の設定に問題があるか、いろいろ見直しましたが、デフォルトの低速オンチップクロックから抜け出せないようです。

仕方ないので、PDG2による設定を諦めて、クロック関連のレジスタをはじめからひとつずつ設定すると正常に動作するようになりました。
チップバージョンAの100ピン版では正常に機能していたので、チップバージョンCの68ピン版でも問題ないと考えていましたがそうでもないようです。

PDG2の設定に何か不具合が考えられるでしょうか。68ピン版ではなにか特別な設定が必要でしょうか。

ご存じの方、いらっしゃいませんか。