hkobaさん、エビスクラウンです。
直接は無理だと思います。方法としては、サブコマンドファイルを利用し、absからbin、motを作ることになると思います。
どの程度までHEWやコマンドラインの使い方を知っているかにもよりますが
RXを例にすると
方法１．ビルドフェーズを追加する
順番はどちらでもいいのですが、リンカフェーズでbinを作成、リンカフェーズの後に新規フェーズを追加してこちらでmotを作成する。
リンカの使い方を知っている必要があります。
方法２．MAKEビルドを行う
bin出力設定でmakeファイルを出力します。一方でmot出力設定にしてmakeファイルを出力し、両者の差分と取ります。恐らくリンカ部分のみ異なると思いますが、binのリンカ出力部分をmotリンカ出力部分に追加します。
--makeの概要--
1.ライブラリジェネレータ
2.コンパイラ
3.リンカ(bin出力)
4.リンカ(mot出力) ← 追加
いずれにせよ、設定以後のビルドではbinとmotの両形式が出力されます。
下記画像は方法２．で出力したものです。