HD64F36049HVを5Vで使用していましたが、新たに3.3V回路での使用を試みたところ、プログラム書込みのインターフェースがうまく動きません。
ボーレート設定、フラッシュROM消去までは正常に動作しているようですが、その後の制御プログラムダウンロードが始まると動作が停止（ホストへのリターンが無くなり）ます。
5V環境では正常に動作している回路を3.3Vに転用しています。（水晶発振器は約9.8MHzで動作）
想定される原因がありましたら教えて下さい。
Vccは内部で3Vレギュレータにつながって3Vを用意し、それで駆動します。VCLがレギュレータの出力を安定させるためにキャパシタ接続端子になっているのでこのピンの電圧が3Vになっているか確認してみてはどうでしょうか？もし、3Vになってないなら動かない理由は電源周りになります。内部電源を使わない回路も可能で、その場合はVCLとVCCはショートして同じ電圧を加えるます。その電圧範囲は3から3.6Vとしてください。